Confira os conteúdos escritos por Pedro Vidigal

Visualização de dados de genomas

A visualização de dados genômicos é usada para organizar, representar e comunicar as informações biológicas associadas aos genomas e explorar os dados para possibilitar a geração de hipóteses. Ao longo […]

Scaffolding de genomas

Os softwares montadores de genomas geralmente produzem conjuntos de contigs fragmentados devido às limitações das tecnologias de sequenciamento e à complexidade dos genomas. Os métodos de scaffolding são utilizados para […]

Redes Filogenéticas

O A história evolutiva compartilhada por um conjunto de organismos geralmente é representada por uma árvore filogenética, que impõe uma estrutura estritamente bifurcada [1,2]. Entretanto, cenários evolutivos mais complexos que […]

Protein Families Database (Pfam)

O banco de dados Pfam (http://pfam.xfam.org/) reúne informações sobre famílias de proteínas, sendo amplamente usado na anotação funcional de genomas, transcritomas, proteomas e metagenomas [1].  O Pfam é organizado a […]

Predição de Secretomas

As proteínas produzidas pelas células são transportadas para diferentes compartimentos subcelulares para desempenharem suas funções biológicas. Algumas dessas proteínas são secretadas para fora das células e desempenham funções importantes nas […]

Pangenômica

O Pangenoma é o repertório de genes observado nos genomas de organismos de uma determinada espécie ou grupo taxonômico. Esse conjunto de genes é constituído pelo genoma core e o […]